29 stycznia 1952 r. ppor. pil. Marian Rutkowski w locie w składzie klucza, doprowadził do zgaśnięcia silnika. Pomimo dwukrotnej, nieudanej próby uruchomienia silnika w powietrzu udało się mu wylądować, kończąc dobieg w stodole. Samolot został spisany ( pierwsza utrata sprzętu ) został przewieziony do Mierzęcic i przeznaczony na pomoce dydaktyczne w dziale nauk. 

Pierwsza katastrofa pułkowa, to wypadek ppor. pil. Franciszka Młynka  podczas nocnych lotów. Samolot spadł koło miejscowości Racławice koło Olkusza - samolot Jak-23 nr fabr. 718 nr boczny 43.

Wypadek Lim-1 w dniu  28.07.1954 r., w którym ginie chor. Abramek Stanisław.

Wypadek ppor. Żarnowski Jan. Ląduje przymusowo na Jaku 23 nr. fabr. 908  nr boczny 33 wypożyczonym z 2 plm w Krakowie. Nomen omen -  samolot jest osobistą maszyną płk Chromego. Wypadek miał miejsce 13.08.1954 r. koło Częstochowy.

 11.03.1955r. roku awaryjnie w miejscowości Przyszowice koło Gliwic lądował ppor. pil. Kazimierz Ciapała. Obecnie, pułkownik pilot w stanie spoczynku.

W kwietniu 1955r. na lotnisku w Mierzęcicach, zorganizowano loty metodyczne dla krakowskiej dywizji. 12 kwietnia doszło do katastrofy lotniczej, w której ginie płk. pil. Szewczenko Arkadiusz  ( doradca dowódcy dywizji ) - drugi pilot kpt. Orczyk Zygmunt (pomocnik dowódcy dywizji d/s strzelania powietrznego ) z ciężkimi obrażeniami przeżył dzięki temu, że spracował fotel. Samolot UT MiG 15 nr. fabr. 26013 nr. boczny 5. Samolot był na stanie 39 plm-u w Mierzecicach.

W dniu 04.10.1984r. na samolocie Mig -21SPS nr. 6605 należącym do 39 plm-u w czasie zawodów użyteczno-bojowych w Mińsku Mazowieckim w TWA - w wyniku złej podzielności uwagi, pilot zmniejszył wysokość i prędkość lotu do niebezpiecznie małych wartości i nie widząc możliwości przeciwdziałania przeciągnięciu samolotu, podjął słuszną decyzję katapultowania się z samolotu. Katapultowanie nastąpiło na wysokości 75 m przy prędkości 200 km / h. Za przyczynę wypadku komisja uznała, niewłaściwą organizację lotów - pilot wykonywał lądowanie w warunkach nie odpowiadających poziomowi wyszkolenia.

 W dniu 14.08.1986r. roku na samolocie TS-11 Iskra nr 1906  w ZWA  w miejscowości Świerklaniec, nastąpiło awaryjne lądowanie samolotu. Czas lotu s-tu to 4.5 min.

Komisja za przyczynę wypadku uznała złamanie zasad bezpieczeństwa latania.